武元年通关文牒
在全国平定之后，清政府亟需在政治上实现对新占领地区的统治，在军事上裁减军队以减轻财政上的压力因此，早在占领云贵之初，便向这些地区派出了行政官吏，而后不久，又计划撤回和裁减八旗及绿营军队清朝的这些措施，无疑是和当时整个社会都需要休养生息的要求相符合的但是，由于十几年来吴三桂政治、军事势力的迅速增长，清朝的这些措施却触犯到吴三桂本人的利益
就吴三桂方面说来，在南明政权尚未消灭之前，他与清政府命运相连，必须拼死作战他在镇守云南后实行了以下措施：在政治上，为了巩固自己的地位，对于辖下的各级官吏，他“选用自擅”，“各省员缺，时亦承制除授，谓之西选”当时清廷所给云、贵二省督抚的敕书，都要写入“听王节制”四字
与此同时，他还以重金收买在京朝官及各省将吏，为自己效劳他还招纳李自成、张献忠余部，编为忠勇五营、义勇五营，加紧训练此外，吴三桂还纵容部下将吏为非作歹，鱼肉百姓，“杀人越货，毫无畏忌，讼牒、命盗两案，甲兵居其大半”
登基称帝
康熙十三年（1674年）十一月初五，吴三桂率兵经潭州至衡阳，以衡永郴桂道衡州知府衙门（旧衡阳市衡南区政府所在地）为“行殿”，指挥各路军事[20]
康熙十七年（1678年）三月初一日，吴三桂登基称帝，改衡州府（今衡阳市）为“应天府”，改钟鼓楼为“五凤楼”，回雁门为“正阳门”，大街名“棋盘街”等，一切用京城名称，册妻张氏为皇后，孙吴世璠为皇太孙，加封文武，百官颁制新历，铸“昭武通宝”、“利用通宝”钱币称帝时狂风大作，将临时搭的帐篷都吹倒了八月举行云、贵、川、湖乡士，录取者73人[21][57]
经济
在镇守云南时期，吴三桂在经济上也有很大的势力他占据明代世镇云南的沐氏庄田700顷作为藩庄，又和西藏的达赖喇嘛在北胜州互市，以茶换取蒙古的马匹又派许多人出兵去做生意，贩运辽东人参及四川的黄连、附子，以牟取利润他曾大量地贷钱给商人使用，谓之藩本他强征关市之税，开矿鼓铸
吴三桂欲效明代沐氏故事，世守云南，所以从各方面培植自己的势力，以求达到这个目的其他尚、耿二藩也和吴三桂一样，其藩下兵各有15佐领，又绿旗兵各有六七千，并且也是经商括财，强征市税，遍置私人，坐地称霸
军事
助清入关
清军到达山海关外十里处后的当天下午，清、吴联军和李自成为数甚少的农民军交战于山海关外的一片石次日，四月二十二日爆发了决定命运的石河大战根据清、吴双方的约定，首先由吴三桂率领所